Objectifs
L'objectif général du M2R BBCM est de former, à et par la recherche, des spécialistes de biochimie, biologie cellulaire et moléculaire capables d'intervenir sur des problèmes de développement, de prolifération, de différenciation, de stress, de mort, et de signalisation cellulaires sur des modèles animaux et végétaux.
Contenu
PROGRAMME du Master Recherche biochimie, biologie cellulaire et moleculaire:
A - TRONC COMMUN ( 95 h).
1 - Méthodologies (46h) :
Stratégies d'études du génome et du protéome: 10 h (enseignement commun aux
M2R BBCM et Sciences de l'Alimentation et M2P TPGB)
Méthodes d'études biophysiques et physico-chimiques: 10 h (enseignement
commun aux M2R BBCM et Sciences de l'Alimentation)
Méthodes immunologiques; 2 h
Méthodes de transgénèses; 3 h
Expression génique; 3 h
Marquages cellulaires et imagerie dont: immunohistochimie, cytochimie,
hybridation in situ, Imagerie calcium, GFP etc..; 4 h
Bioinformatique; 8 h (dont 6 h de pratique)
Biostatistiques ; 6 h
2 - Signalisation cellulaire et moléculaire animale et végétale incluant la signalisation
lipidique (16h). Responsable : A. PUGIN : e-mail pugin@dijon.inra.fr
Interactions ligands/récepteurs et cascades de transduction liées à l'AMPc ou
GMPc
Signalisation cellulaire et moléculaire dans les réponses aux stress biotiques ou
abiotiques chez les végétaux
PKC et apoptose
NO chez les mammifères et chez les plantes
RNA interférence
Signalisation par récepteurs nucléaires
Mécanismes de signalisation chez les bactéries via le module MAPK
Interactions cellules-cellules.
3 - Démonstrations (8h) 4 séances de 2h au choix
PCR quantitative; génotypage; microscopie confocale; cytométrie en flux;
transformation des plantes par biolistique ; électrophorèse 2D des protéines et
analyse d’image.
4 – Langues étrangères (25 h) .
Anglais
B - OPTIONS (48 h)
L'étudiant suivra une option de 48 h de son choix parmi les 3 options suivantes:
Chaque option est découpée en 4 modules de 12 h accessibles à tout étudiant quelle que soit
son option "prioritaire".
2 des modules de chaque option pourront être spécifiques (obligatoires) de l'option.
Option 1 « Cancer et mort cellulaire » (48 h)
- Module mort cellulaire – (12h) : Apoptose, Autophagie, Sénescence, Catastrophe
mitotique, Nécrose, Néose, dans les cellules eucaryotes et les cellules végétales -
application aux myélodysplasies et traitements anticancéreux -
- Module différenciation – (12 h) : Différenciation hématopoïétique, différenciation
musculaire, régulation génétique et épigénétique, épissage alternatif. application aux
leucémies (leucémogénèse et thérapeutique) -
- Module réponse immunitaire – (12 h) : Cellules T régulatrices - Cellules dendritiques -
Mort cellulaire et réponse immunitaire - Cellules NK - Appplication à la réponse
antitumorale et à sa manipulation thérapeutique. -
- Module nutrition et cancer - (12 h) : Le rôle des polyphénols - Régime alimentaire et
cancer - Détoxification des xénobiotiques - la cancérogénèse intestinale. Oncogénèse
mammaire.
Option 2 « Santé/nutrition » (48 h)
- Module transport et métabolisme des lipides (12h) : / *lipid-binding proteins,
lipoprotéines, protéines de transfert (CETP, PLTP),
- Module mitochondries : physiologie et physiopathologies (12h)
- Module lipidomique : régulation des gènes par les lipides (12 h) : contrôle des canaux
ioniques, récepteurs nucléaires (PPAR, LXR, FXR…), facteurs de transcription
(SREBP…),
- Module Comportement alimentaire (12h) :/ Neurobiologie du comportement
alimentaire, gènes de l’obésité, pathologies et déviances alimentaires, développement
périnatal des préférences alimentaires, anthropologie nutritionnelle. (module commun au
M2R « Sciences de l’Alimentation »)
Option 3 « Biosciences végétales » (48 h)
- Module dynamique des membranes – (12 h).
Trafic intracellulaire, dynamique du système vacuolaire, transport de nutriments lors de la
symbiose, domaines membranaire: de la biochimie à la physiologie, importation des protéines
dans les organites semi-autonomes, processus d’autophagie ou autocanibalisme cellulaire.
- Module Interactions Plante-Microorganismes – (12 h).
Signalisation cellulaire par des éliciteurs de réactions de défense, rôle des formes actives de
l’oxygène et de l’azote dans les réponses de défense de la plante, génomique fonctionnelle des
interactions mycorhiziennes entre plantes et champignons symbiotiques, résistance
systémique acquise, mort cellulaire (réponse hypersensible).
- Module génomique fonctionnelle et développement – (12 h).
L’outil génomique fonctionnelle, développement de la graine, la levure de bière
(Saccharomyces cerevisiae): outil de la génomique fonctionnelle des eucaryotes, signalisation
cellulaire dans la coordination du développement de la graine.
- Module Biologie Intégrative – (12 h).
Duplication des génomes végétaux: rôle dans l'évolution des plantes, développement et
réponse des plantes régulés par épigénétisme (ou signalisation nucléaire), compréhension
d'une interaction plante-pathogène par une approche intégrative, rôle des composés volatiles
végétaux dans les interactions multitrophiques, étude de la phytorémédiation chez le peuplier.
C - CONFERENCES : 5 Conférences sur des sujets d'actualité par des collègues extérieurs
à l'Université de Bourgogne et à l’Université de Franche Comté.
D - RAPPORT BIBLIOGRAPHIQUE SUR LE SUJET DE STAGE
E - TRANSVERSALITE (12h)
